Abstract
The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumors to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences and emergent themes across tumor lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first 12 tumor types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumor types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 1113-1120 |
| Number of pages | 8 |
| Journal | Nature Genetics |
| Volume | 45 |
| Issue number | 10 |
| DOIs | |
| State | Published - 1 Oct 2013 |
| Externally published | Yes |
Bibliographical note
Funding Information:We thank J. Zhang for the administrative coordination of TCGA Pan-Cancer Analysis Working Group activities, C. Perou and K. Hoadley for contributions to Figure 1, and A. Margolin, D. Wheeler, M. Meyerson and L. Ding for comments on early drafts of the manuscript. The study was funded by the National Cancer Institute and the National Human Genome Research Institute.
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In: Nature Genetics, Vol. 45, No. 10, 01.10.2013, p. 1113-1120.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - The cancer genome atlas pan-cancer analysis project
AU - Weinstein, John N.
AU - Collisson, Eric A.
AU - Mills, Gordon B.
AU - Shaw, Kenna R.Mills
AU - Ozenberger, Brad A.
AU - Ellrott, Kyle
AU - Sander, Chris
AU - Stuart, Joshua M.
AU - Chang, Kyle
AU - Creighton, Chad J.
AU - Davis, Caleb
AU - Donehower, Lawrence
AU - Drummond, Jennifer
AU - Wheeler, David
AU - Ally, Adrian
AU - Balasundaram, Miruna
AU - Birol, Inanc
AU - Butterfield, Yaron S.N.
AU - Chu, Andy
AU - Chuah, Eric
AU - Chun, Hye Jung E.
AU - Dhalla, Noreen
AU - Guin, Ranabir
AU - Hirst, Martin
AU - Hirst, Carrie
AU - Holt, Robert A.
AU - Jones, Steven J.M.
AU - Lee, Darlene
AU - Li, Haiyan I.
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AU - Robertson, A. Gordon
AU - Schein, Jacqueline E.
AU - Sipahimalani, Payal
AU - Tam, Angela
AU - Thiessen, Nina
AU - Varhol, Richard J.
AU - Beroukhim, Rameen
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AU - Brooks, Angela N.
AU - Cherniack, Andrew D.
AU - Freeman, Samuel S.
AU - Gabriel, Stacey B.
AU - Helman, Elena
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AU - Meyerson, Matthew
AU - Ojesina, Akinyemi I.
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AU - Bristow, Christopher A.
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AU - Hamilton, Mark
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N1 - Funding Information: We thank J. Zhang for the administrative coordination of TCGA Pan-Cancer Analysis Working Group activities, C. Perou and K. Hoadley for contributions to Figure 1, and A. Margolin, D. Wheeler, M. Meyerson and L. Ding for comments on early drafts of the manuscript. The study was funded by the National Cancer Institute and the National Human Genome Research Institute.
PY - 2013/10/1
Y1 - 2013/10/1
N2 - The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumors to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences and emergent themes across tumor lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first 12 tumor types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumor types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
AB - The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumors to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences and emergent themes across tumor lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first 12 tumor types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumor types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
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JO - Nature Genetics
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